正当筹备工作紧张进行时，意外发生了。一名负责采购木料的弟子在途中被劫杀，随身携带的图纸失踪。林远连夜排查，发现是严党安插在当地的眼线所为。他立即向张居正汇报，首辅当机立断：\"放出假消息，就说朝廷在试验新式河船，同时加强戒备。\"林远依计而行，一面散布\"漕船改良\"的谣言，一面加强工坊戒备，在四周埋设机关陷阱，安排天枢护卫队日夜巡逻。

为测试新船性能，林远再次征得张居正同意，决定在深夜进行试航。月光洒在海面上，第一艘改良后的福船缓缓驶出港口。当船只顺利通过暗流涌动的海峡，在风浪中保持平稳时，老工匠陈阿海激动得直跺脚：\"成了！这船比当年的宝船更轻便、更坚固！\"

试航成功后，林远着手组建\"隐海船队\"。他通过兵部秘密调派了一批退伍水兵，又在沿海渔民中招募精壮劳力，对外宣称是\"漕运衙门临时护卫队\"。船员们经过严格训练，既能驾驶船只，又能应对海盗袭击。船队采用暗号联络，每艘船配备特制的信鸽，以便在紧急情况下向附近驿站传递消息——这些驿站早已纳入物流监查司的秘密网络。

此时，朝廷内部对是否开放海运的争论愈发激烈。保守派以\"祖制不可违\"为由坚决反对，而张居正等有识之士则力主尝试。林远趁势秘密上书，详细阐述了海运的可行性和战略意义，并附上试航报告与成本分析：\"一旦倭寇封锁沿海，海运可作为奇兵，将物资运抵辽东；平时则可降低运输成本，增加朝廷赋税。\"

在张居正的暗中运作下，万历皇帝终于松口，同意进行小规模海运试点，但严令\"不可声张，以免惊扰沿海百姓\"。林远抓住机会，将第一批货物——五百石粮食和军用物资装上隐海船队。为确保安全，船队分成三路，沿着不同航线驶向辽东，每艘船上都藏有盖着户部密印的\"墨印竹简\"，记录着航行日志和货物清单，一旦遭遇不测，竹简可随浮标漂流，成为追责证据。

当船队顺利抵达辽东时，总兵官望着完好无损的货物，惊叹不已：\"陆运需半月，海运竟只需五日，且损耗不足一成！\"消息传回京城，张居正借机在朝堂上展示了海运的账本与捷报，虽未明言背后筹备细节，却已让保守派哑口无言。但林远并未放松警惕，他知道，倭寇和严党绝不会坐视海运发展。果不其然，在船队返航途中，遭遇了倭寇的伏击。

隐海船队早有准备，凭借灵活的船身和张居正暗中调拨的火器，与倭寇展开激战。天枢护卫队成员登上倭寇船只近身搏杀，暗影小组成员则趁机烧毁对方的补给船。战斗持续到黄昏，倭寇见占不到便宜，只得仓皇撤退。

这场胜利让万历皇帝龙颜大悦，私下对张居正赞道：\"林卿家果然堪当大任。\"而林远则趁热打铁，在沿海各地设立秘密补给点，这些补给点表面上是\"官办渔货中转站\"，实则储备淡水、粮草和维修工具；同时训练第二批船员，扩大船队规模。站在漳州月港的码头上，看着一艘艘福船在夜色中起锚，林远深知，大明的海上物流之路才刚刚开始，而背后有了朝廷的默许与支持，他终于能更从容地与倭寇、严党展开较量。